明朝中叶,倭寇不断骚扰东南沿海,东瀛柳生一族辅佐德川家康之余亦要席卷中原武林。于是“东瀛霸刀”柳生(任达华饰)杀入武林、所向披靡,亦要向中原武林第一高手“天剑”独孤无极(刘松仁饰)挑战。独孤无极正要与新婚妻子梦青丝(杨紫琼饰)成亲,却不得不为此事拖延。他向“鬼医”(吴孟达饰)求助,遂用剧毒将自己功力提高数倍。比武之日,独孤无极力战柳生,将其赶走,自己却被体内毒气错乱神经,以致糊涂杀死山庄里无数友人,并气走青丝。青丝自此男装打扮,化名独孤贞,杀尽天下负心人。
鬼医弟子吴通(张卫健饰)为了逃避年纪比他大许多的未婚妻牛娃(郑裕玲饰),成婚当日逃走,巧遇微服出游的天香公主(张曼玉饰)和贴身侍卫(吴君如饰),三人发生争执,此时独孤贞出现解围。而此时镇上却在传言梦青丝在妓院摆出迷魂阵召贤比武的香艳传闻,惊讶的独孤贞于是与吴通一起前去探个究竟......。本片是以日本历史上被下层武士奉为神明的武市半平太,发动天诛为故事背景,讲述旗下忠实的追随者“人斩以藏”的故事。武市半平太(仲代达矢饰)于江户建立了土佐勤王党。同时以藏(胜新太郎饰)加入勤王党,并于次年结识田中新兵卫(三岛由纪夫饰),两人作为勤王党的两大“人斩”,活跃于维新幕后。冈田以藏教育程度不高,言谈粗鄙,粗野莽撞且好酒色,但杀人如麻且对武市半平太言听计从.唯一的例外是在坂本龙马(石原裕次郎饰)介绍下担任了胜海舟的护卫。由于土佐藩开始对土佐勤王党进行镇压,党首武市半平太被捕。随之冈田以藏被捕。庆应元年(1865)闰五月十一日,武市半平太被命切腹自尽,而以藏等九人则被处以斩刑。
以藏临终对自己不能被允许切腹而感到耿耿于怀,感觉哪怕是死都得不到平等对待,留下一首辞世之句:君が為め尽くす心は水の泡,消えにし後は澄みわたる空*(我为君尽心尽力,却如水泡一般消逝在澄空中”)。另外本片主演之一的三岛由纪夫相隔一年“切腹报国”。这起极端事件使得很长一段时间里《人斩》这部电影处于被禁言状态。。一百零八好汉聚义梁山,随后在及时雨宋江的率领下接受朝廷招安,继而成为南征方腊的先锋军。两军对垒,小李广花荣(陈浩民 饰)射杀对方的军师邓元觉,扬名沙场。平定叛军后,李广获封应天府兵马都统。在此之前,应天府一直由兵马副都统雷震(吴毅将 饰)坐镇,此人高傲自大,专横跋扈,加上抱定了大奸臣蔡京的粗腿,因此对花荣毫不恭敬,时刻寻找陷害英杰忠良的机会。花荣凭借高超的武艺和豪爽重义的性格令应天府部分官员和绿林好汉的钦佩,而在此期间他还遇到了色艺俱佳的歌妓潇潇。殊不知这个女孩却和他有着纷繁复杂的渊源。
未过多久,曾经方腊手下的神射手小养由基庞万春秘密潜入应天府,由此惹来连场纷乱……。