Rainbow刚从北部转学到泰国南部的一所国际学校,没多久就成为众人焦点,因为在她以前的那所学校发生了一起学生神秘死亡事件,而她的众多新伙伴对此事十分好奇,想探个究竟。Rainbow把此事归咎于一个神秘的电话号码:999-9999,据说不管是谁,只要拨打了这个电话,就能实现一个愿望。她那位同学显然拨打了此号码并且实现了他的愿望,但那不久就被发现吊死在旗杆上。尽管Rainbow再三警告现在的新同学,但是一些人并不以为然,想一试究竟。尽管他们各种各样的愿望都被实现,但接下来一个个都神秘死亡,最后这批人里面仅有SUN还活着。但死亡正步步逼近,因为他也许了个愿望并且实现了。Rainbow和Sun必须一同解开这个神秘的邪恶号码,保全自己的性命。。在第二次新吉恩战争、别名“夏亚的叛乱”终结后,地球圈取得了短暂的和平。 这之后3年,宇宙世纪0096年。在工业殖民地“工业7号”上进行了一项秘密交涉。内容为--被认为是地球联邦政府暗中操控的“比斯特财团”将把最高机密“拉普拉斯之箱”交给新吉恩的残党军“袖付”。 另一方面,在安纳海姆工业专门学校就读的少年巴纳吉·林克斯遇见了自称为奥黛丽·本的少女(实为旧吉恩公国次男多兹鲁·扎比之女,美耐巴·扎比)奥黛丽为了制止新的战争爆发,必须组织“拉普拉斯之箱”的交易。巴纳吉在数次帮助奥黛丽之后,逐渐被她所吸引。 随后,地球联邦察觉了这起交易,并进行军事介入,工业殖民地随即化为一片火海。巴纳吉和同伴一边避难一边寻找着奥黛丽,而出现在他面前的是比斯特财团的当家卡迪阿斯·比斯特。奄奄一息的卡迪阿斯将出生的秘密告诉了巴纳吉,并且将箱之钥匙--“机动战士高达独角兽”托付给他...。