《自古英雄出少年》从古今中外浩瀚巨大的历史文库中,选取了100名少年英雄的典型事迹,用广大青少年喜闻乐见的动画艺术形式塑造了一大批中国式的英雄形象,集中体现了中华民族各个历史时期少年英雄的精神风貌,歌颂了他们“热爱祖国、热爱人民、热爱科学、勇于献身”的崇高精神和机智、聪敏、好学以及人类真、善、美的品德。
动画片中的少年英雄谱上有勤学苦练的少年孔子,从母亲断杼择邻顿悟明志的孟子,情暖母心的孝子闵子骞,刻苦学习的屈原和神医华佗;有唐朝智勇斗贼的少年区寄,明代的识鬼少年王海日,西晋勇于改过的周处;有兄弟民族的少年成吉思汗,高原之鹰松赞干布;有现代大革命时期的机智小交通员,抗日战争中的二小放牛郎和80年代的哈萨克小红花;还有外国的反法西斯女英雄卓娅,巴黎公社小英雄以及聪明的爱迪生,从生命的弱者成长为强者的海伦·凯勒等。。故事講述求生專家柏特蓋默受雇到南非獵補兇猛的食人野獸,他有夥伴崔維斯威克的協助,將與怪獸開展一場生死對決大戰,然而這些受到進化影響的怪獸,完全超乎他們原先的想像。。在极北基地遥远的上空的阿加斯蒂亚基地,其内封印的一本危险的禁书被禁书库守护者阿斯莫德解放,假面骑士、超级战队以及现实世界由此产生崩坏。《假面骑士圣刃》和《机界战队全开者》的角色相互穿越到了对方的世界里,《超级战队》系列和《假面骑士》系列的作者,幼年章太郎也被带入书中世界。介人与伦太郎及小赤穿越到了西游记,变化为三藏一行人,奉守护真经的魔王的命令去寻找到失落的真经。而飞羽真一行及章太郎穿越到了八犬传的世界,与历代英雄和介人一行一同成为了八犬士。新的假面骑士利维斯也首次登场,与大家联手一起打败了阿斯莫德率领的怪物军团。章太郎也在这次经历中找到了自己的梦,并立志高中毕业后去东京当一名漫画家,画下飞羽真和介人的英雄故事。。