由于童年的悲惨遭遇,直枝理树(堀江由衣配音)的个性变得十分孤僻。长着一张娃娃脸,沉默寡言,没有朋友,这样的理树成为了大家眼里的怪胎。某一日,性格傲娇爱猫如命的枣铃(民安智惠配音),正直开朗稳重可靠的枣恭介(绿川光配音),四肢发达头脑简单的井之原真人(神奈延年配音),成熟勇敢剑术一流的宫泽谦吾(织田优成配音)四人出现在了绝望的理树面前。他们自称“Little Busters”,想要利用理树的力量来完成拯救世界的重任。 就这样,理树成为了LB中的一份子,整日奔波解决一些说来宏大但其实十分平凡的委托。在相处的过程中,本来行为举止十分怪异的同伴们渐渐的变得可爱起来,理树也逐渐敞开了紧闭的心门,找回了久违的快乐。他开始明白,只要有一颗开朗向上的心,这样的生活一定能够继续下去直到永远。。年轻女孩陈晓娜与弟弟相依为命,且为了躲避仇人四处漂泊。姐弟二人搬到新公寓的当天,陈晓娜意外撞见一起疑似绑架案,胆小怕事的她不敢声张,但几天后出现了一个姓陶的年轻人,似乎正在调查此案。
陈晓娜不愿惹麻烦,可她发现公寓里邻居们的行为举止很奇怪,小陶反而是其中唯一正常的人。之后公寓里又发生了很多怪事,陈晓娜的弟弟失踪,绑架案的凶手似乎也盯上了陈晓娜。就在陈晓娜情绪快要崩溃时,陶医生通过引导,使陈晓娜逐渐发现自己身处一个虚假的世界,而所有的设计是为了治疗她的多重人格障碍。
陶医生利用一种可以连接意识层面的仪器,将陈晓娜的多重人格引入他搭建的精神世界,终于找出了陈晓娜发病的深层原因,帮助她战胜了内心的恐惧,打败了病魔。。