自有人类以来,“污秽”就不断的现身骚扰着人世间的安稳和宁静,为了对抗污秽,一群名为“阴阳师”的人们勇敢的站了出来,加入到了战斗之中,用他们的智慧和勇气守护着人类。少年焰魔堂辘轳(花江夏树 配音)立志要成为史上最强阴阳师,却因为一场悲剧的发生而意识到灾难的不可逆转,遂放弃了理想,沦为路人。
某日,一位名叫化野红绪(潘惠美 配音)的京都少女出现在了辘轳的身边,两人在误打误撞之中开始了同居生活。红绪铲除污秽的决心渐渐感化了辘轳,让他再度看到了希望,燃起了热血。与此同时,辘轳发现,红绪的哥哥石镜悠斗(村濑步 配音)和当年令自己失去一切的灾难有着千丝万缕的关联。。影片开始是纪录片风格的打斗场面:一群蝎子跟老鼠对抗;接着呈现出游击队跟主教军的斗争;贯串全片多是违反一般常规的视觉形象,而自由的程度也大得惊人 :发怒的蝎子、维苏威火山喷出的熔岩和带有纪录性的场面;极端超现实场面、标新立异的场面交替出现:如一头母牛躺在一个年轻女孩的床上;基督变成了性虐待狂患者;作父亲的毫无感觉地开枪射杀自己的小孩,当仆人房舍起火,他却置之不理,甚至一辆牛车穿入房间,他也视若无睹;爱人们朝夕渴望相聚,但见面后却感到无所适从,只有进行集体损毁,将犁耙、长颈鹿、圣诞树焚烧;两个主教从楼上被仍了下来。更有甚者,一对爱人的眼睛被挤出,手被咬掉,在一条狭窄街道的碎石上翻滚着,同时可以听见艾吕声音唱到“爱情,爱情,爱情呀!”一种近乎神秘的爱情概念作为一种可以改变一切的,可以为人们赎罪的东西……。不堪忍受奥林匹斯众神残暴压迫的阿戈斯国王亚克里斯奋起反抗,对至高无上的神明大为不敬。在冥王哈迪斯的怂恿下,天神宙斯决定对愚蠢的人类施以惩罚。遭遇海难流落到阿戈斯的青年珀修斯是宙斯和亚克里斯的皇后生下的半神,他亲眼目睹哈迪斯所施下的恐怖神迹,并得知哈迪斯将释放北海怪兽克拉肯惩戒世人,除非亚克里斯将美丽的公主安德鲁美达作为牺牲献给众神。在女神艾俄的点拨下,珀修斯知晓了自己的身世与使命,于是决定启程杀死北海怪兽并摧毁哈迪斯的阴谋……。