故事设定在一个从未出现过奥特曼与怪兽的地球上。某天,因意外一名外星人从宇宙坠落。失去过往记忆的外星人“奥美迦”化身为地球人模样,被人称为“宙人”。他对人类充满好奇,积极地接触这些陌生的生命体。
当神秘巨型生物接连出现时,尘封的记忆碎片被唤醒,宙人脱口而出“怪兽”二字。面对怪兽的威胁,强烈的使命感驱使他变身成为奥美迦奥特曼,与怪兽作战。
随着故事推进,来自外星的宙人与一位普通青年逐渐成为并肩作战的伙伴。。该片讲述了国情局秘密王牌特工—“弹头”小组的四位成员“战略大师”艾力克斯、“百变玫瑰”比比、“暴风枭雄”布莱克、“冷刀疯子”柯莉儿被犯罪集团陷害,成了国情局通缉的要犯。通过一系列被追杀、深入敌后、拯救人质等反恐行动,经历一次次的磨难之后,最终摆脱困境,找出犯罪集团首脑并将其一网打尽的故事。。