在“香兰堂”古董店打工的美术院学生仓桥永莉,被古老雕花玻璃杯中映出的金发碧眼的可爱少女吸引,秘密地享受着与这非人幻象邂逅的愉悦。香兰堂位于善导寺商店街地中心,那里出入的都是年轻美丽的女性,然而仓桥却没有任何兴趣,只是迷恋着玻璃杯中的少女。
第七天的夜里,在雕花玻璃杯里,永莉看见了自己将少女杀害的幻象。
然后,从玻璃杯中溢出鲜血,少女的幻象实体化,迫使永莉定下契约。这个名叫“柯婕特”的少女,要求永莉救出自己在“被诅咒器皿”中徘徊的灵魂。“喝下去,如果不想分离……如果不想失去我”,永莉被柯婕特强迫,喝下玻璃杯中鲜血定下“血之契约”。
过了一夜,醒来的永莉已经不能再看到玻璃杯中的柯婕特的身影,于是把这一切当作是梦,重新振作,将玻璃杯卖给了暴发户的富豪。然而,去富豪家中交货时,在那里永莉看见了实体化的柯婕特。回到家中,永莉抑止不住想见柯婕特的心情,再次来到富豪的家中,然而在那里的是已变成尸体的富豪及其情人......
目击柯婕特临死状态的“被诅咒器皿”中的玻璃杯,吸取了富豪他们的鲜血,杀死了他们。之后,这个玻璃杯的怨念附在永莉身上,想要夺其性命......。明治十年,剑心、弥彦、阿薰、左之助一行乘火车来至横滨,甫至此地,便因与几个骚扰年轻女子的外国士兵发生争端,且因此结识了正直的武士时雨泷魁,他们很快成为好朋友。 时政治格局仍动荡不安,诸多反抗明治的志士不断向政府机关以及外国大使馆发动袭击。而时雨正是所谓“新维新”运动的领导者,明治以前,他曾是佐幕派彰义队的领袖之一,其好友“鬼斩”高槻严达即死在拔刀斋剑心的刀下,而被他们所搭救的女孩朱鹭正是严达的女儿。 造物弄人,让这些恩怨纠缠的人以如此方式重逢。得知一切的剑心决定不顾一切阻止好友袭击政府的行动。而另一方面,野心家田母野打算借镇压叛乱分子的良机图谋不轨……。