《审计风云》讲述一个抚养6岁女儿的青年注册会计师,向企业的不正当操作发起挑战。这位会计师坚持“贯彻真实”观点,甚至将自己的好朋友逼上绝路,还一度对自己的理念产生怀疑,而后得知的事实却是银行在幕后操纵一切,借刀杀人。企业的主要资金支柱银行为了填补自己的不良债权,暗中借会计师事务所之手,否定企业的决算报告,使之破产倒闭,将企业大部分的优良资产卖掉后,分拆出来的公司就可以偿还银行的现金借款,企业从一开始就被银行利用来减少自己的不良债权,完全就是炮灰!真是令人心寒的现实!但却是实实在在存在的,用事务所理事长的话来说:如果严格审计全部用到现在的日本经济上的话,会出大问题!原则上应该倒闭的公司,就应该让他们全部倒闭吗?。黑田藩藩主齐隆侯将宠爱的妃子生的女儿滨千代公主假扮男孩,秘密继承储君之位。菩提寺住持慈善和黑锹忍者得知此事,写作秘函送往江户。拜一刀(若山富三郎 饰)受黑田藩所托,追赶主持抢夺秘函。
途中拜一刀遭遇黑田藩忍者不知火(安田道代 饰),从其口中察觉事件背后的秘密。秘函抢夺成 功,柳生烈堂(大木实 饰)派出大量刺客截杀,但全部死在拜一刀手下。黑田藩重臣肋天将监斥责齐隆侯用女儿继任储君,意欲杀其谋反。受不知火所托的拜一刀由此卷入这场继嗣风波之中……。