《黑客帝国动画版》由9段以《黑客帝国》系列电影世界观为基础生发出的短片组成,各篇的角度与风格各异,制作班底汇聚了日本、美国、韩国三地的动画精英。《机器复兴》讲述了MATRIX的历史。机器人不堪人类恶劣对待,终于反抗并将人类化为能源。《少年故事》讲述一名少年突然收到来自网络的召唤,而大批黑衣人开始对他展开围捕。《虚拟程序》展示了一对男女在虚拟训练程序中的片断。《世界纪录》描写一位短跑运动员在接近突破人类极限时终被系统牢牢控制。《超越极限》叙述因为系统错误,平静的街区中出现了一片超常区域。《侦探故事》描写一位侦探被步步引领着试图摆脱系统的桎梏。《矩阵化》讲述一只机器人被人类捕获并驯化的故事。《终极战役》记录了一艘飞船毁灭的经过。。Kyle(马特·达拉斯 Matt Dallas 饰)一直在探寻自己身世之谜,终于他遇到了Adam,知道了自己的来历和潜力。他回到Trager家,并在Tom严格的训练下学会能力范围内的所有本领。每个人的情况都不太好,Nicole(玛格丽特·马科林苔 Marguerite MacIntyre 饰)变得很沮丧并辞掉了工作;Stephen(布鲁斯·托马斯 Bruce Thomas 饰)不得不接替她;Lori(艾普萝·美森 April Matson 饰)和Declan(克里斯·奥利维罗 Chris Olivero 饰)关系紧张;Josh(让-卢克·比洛多 Jean-Luc Bilodeau 饰)则是一如既往。神秘公司Madacorp找到了一个陌生女孩寻找Kyle。这个女孩不仅成为了Kyle生活的一部分,也走进了Trager一家的生活,所有的人都处在危险之中......。