夜幕笼罩下的东京霓虹闪烁,在城市某个不起眼的角落,充满温情的深夜食堂悄然开张。妖媚的川岛玉子一脸颓唐,她的靠山不久前去世,却没给她留下分文遗产。在颓唐无助的时候,貌不惊人的上班族小初走入玉子的视野,他们的关系迅速拉近。乡下女孩栗山美知留独自来到东京,走投无路之际她在老板这里吃了霸王餐,事后主动登门要求打工还钱,女孩因此找到了暂时的栖身地。3•11大地震让福岛灾民大石谦三和来自东京的志愿者杉田明美相识。大石对后者展开狂热的追求,甚至尾随来至东京。
平凡人的小故事,在深夜食堂内交替上演……。十年前,一伙倭寇袭击沿海,被明朝大军拿下,其首领东野吾郎被斩首示众,首级悬挂于城门之上。谁知东野吾郎早有遗书,他安排自己精通汉语的妻子假扮汉人,将两个孩子送了人。
几十年后,明朝倭寇之乱已近平息。常德府捕快卜曼痴迷工作,业绩直逼上司,被派往全国模范县桃源县担任巡检司巡检。
桃源县穷乡僻壤,但民风淳朴,十几年未出一件大事。卜曼带着两个半吊子捕快——追风和夺命,在这里结识了为人谦和的县令刘东崇,医术精湛的女仵作沧衣,一切看起来都其乐融融。但桃源县有座不知供奉着什么神的庙,引起了卜曼的注意。
风平浪静的县城却在卜曼到来后接连发生了一系列神秘的案件,卜曼不忘初心誓死追查,终于揭开了小小的县城里蕴藏着的关乎大明社稷的秘密。。