故事发生在日本的元志元年,江湖险恶,人心动荡。为了复仇,个头矮小父母双亡的少年铁之助(小林由美子 配音)以成为“鬼”为目标,要求加入当时十分有威望的武士组织新撰组。在新撰组里,铁之助认识了外表温柔剑术高超的一番组组长冲田总司(斋贺弥月 配音),以及外表鬼畜却心思细密的新撰组副长土方岁三(中田让治 配音)。组中各类有趣的人等让铁之助的生后变得多姿多彩,而柔弱的少女沙夜(高桥美佳子 配音)更是撩动了少年稚嫩的心弦。
在新撰组内,严明的纪律必不可少,有时甚至严苛到了违背人性的地步。目睹着和激进攘夷派做着不懈斗争的组员,看着他们为了维护自己的尊严宁可丢失性命,铁之助在心里暗下决心,要让这武士道精神流传下去。。有一户人家,他们世代隐居在由高墙和篱笆围起的一方天地里。与世隔绝的他们不论外界的时代如何更替,文明怎样进展,仍然固守着古老的生活方式,简朴、素雅、纯真。有时候,丰沛的阳光会穿过茂密的守护森林,毫无保留地照耀着每一棵古树、每一寸厚土,也照耀着光影里两个精灵般嬉戏时而消失又突然显现的少年。 成长的路总不是一片坦途,正如叛逆的阵痛永远会如期而至。眼看着新鲜力量就要冲破这亘古的高墙和藩篱,然而母亲的离奇暴毙,妹妹的突然失踪,父亲愈发的心事重重,都令少年更加坚信自己身处在一个古老而危险的秘密之中,而这个秘密的答案,也许就能解开羁绊在自己和妹妹身上的神秘力量的终极谜题...... (转自树屋字幕组)。