小行星撞击地球,主要大地受到名为「忍」(シノビ)的毒害,形成异形攻击人类,人们只能逃向以前是海底的「海陆」;拯救的方法唯有复活「机神将」(机神将(ギガロード))。约五百年后,亡国「伊势」的公主巫女雨、与拥有人间兵器「柳生」(ヤギュウ)之血的少年周防二人挺身而出……。在浩瀚的宇宙深处,驻扎在某小行星的地球联邦军队凯西堡垒遭到宿敌虫子大军的攻击。强袭舰雅丽莎号的彪勇战将奉命救援,在这个沦陷的基地内,却发生令人费解的一幕。超能力战略官员卡尔·詹金斯博士将卡门所负责的战列舰约翰·A·沃顿号的指挥权夺走,不知下落。战争的最后,雅丽莎号的战士们救出幸存者,小星星也在爆炸中灰飞烟灭。为了查清消失的战列舰的下落,强尼·瑞克命令返航途中的雅丽莎号迅速掉转船头,追赶约翰·A·沃顿号。效用彪悍的勇士们合二为一,开始了新的漫漫征途……
本片为《星河战队》系列发表15周年纪念作品。。《雪豹之暗战天机》的诞生,再次将这一经典IP搬到大荧幕上,不仅继续由原班人马打造,传承原汁原味的“雪豹精神”;还将在此前佳作的基础之上,推陈出新,用惊心动魄的情节展现抗战期爱国人士的智慧,通过他们的成长与蜕变,再现那个时代普通群众的爱国情怀,给观众展现丰富的故事内容,保障传承雪豹IP的精神内核。。