沉默寡言、在班上没有朋友的平良(萩原利久饰),对班上拥有无敌美貌、人气爆棚的“国王”清居(八木勇征饰)一见钟情。几经波折,两人终于拨云见日成为恋人,并展开幸福的同居生活。随着大学即将毕业,平良开始担任知名摄影师的助理,清居也成为新锐演员开始受到瞩目,然而不想成为清居演艺之路绊脚石的平良,却开始逐渐跟他保持距离。将清居视为“神”一般尊贵存在的平良,和只想跟平良成为“普通恋人”的清居,因为无法填补不同想法所产生的隔阂,彼此的鸿沟也逐渐加深。。在参拜母亲坟墓的回程途中,真嗣(绪方惠美 配音)和葛城美里(三石琴乃 配音)遭遇了第七使徒的攻击,关键时刻2号机势如破竹挫败对手,真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾(宫村优子 配音)。与沉默寡言的绫波丽(林原惠美 配音)不同,明日香自信张扬,甚至有些自大,在和真嗣相处的日子里,彼此闹出不少的笑话。他们三人分别驾驶着零号机、初号机和2号机,抵抗了第八使徒猛烈的攻击,在这一过程中,淡淡的情愫悄然在这三个青年男女的心中萌生。不久后,第九、十使徒相继降临,真嗣他们面临着生与死的残酷考验……。