《新大头儿子和小头爸爸》的故事背景是一个普通平凡的家庭,故事所具有的特质是由贴近生活的现实性、浓郁的故事性和精彩的细节所构成。该片故事以细节取胜,节奏自然明快,给小朋友带来了健康的快乐。通过三口之家的温馨故事,以小见大,展现当今社会飞速发展变化中的普通家庭的温馨生活。在笑声和感动中体会正确积极的价值观。。伊藤修司(冈田义德 饰)和吉田浩之(草野康太 饰)是在同一个班级里学习的同学兼好友,实际上,修司对浩之一直存有着超越了友谊的感情,他选择将这份懵懂的感情默默隐藏在心底。浩之和同班的清水彩子(高野久实 饰)正在交往,虽然彩子个性温柔又开朗,但浩之始终觉得两人的关系里透着一种疏离。
原果沙间(滨崎步 饰)饰班级里的“异类”,喜欢独来独往,她特立独行的气质渐渐吸引了浩之的注意。与此同时,修司再也无法压抑心中的感情,对浩之告白了,面对好友真诚的表白,浩之不知道该做出怎样的回应。沙间失踪了,浩之和修司结伴前往她在海边的老家寻找她。。