科学家本隶属于美国政府某个秘密部门,他通过高科技手段训练豚鼠说话与思考,并将它们培养成特工人员。然而,本的部门却面临被FBI关闭的局面,为了证明他和豚鼠特工的能力,本向豚鼠特工队的负责鼠达尔文下令,要它们潜入赛博林工业的CEO罗纳德·赛博的办公室,寻找罗纳德向中东国家出卖可用于军事的高科技芯片的证据。达尔文毫不怠慢,带着布拉斯特、华蕾斯、苍蝇莫奇和斯贝克斯等成员迅速展开行动。
这群豚鼠特工队员体型虽小,却身怀绝技,它们成功闯入罗纳德的办公室,并下载到重要资料。然而,这场冒险才刚刚开始……。戈梅拉岛的丛林中惊现一具男尸,法院判决以指控当地的一名警察而终,而他却不久被无罪释放。三年后,调查员和他的助手重新调查此案,当地警察协助他们,试图找到真凶。随着调查的深入,他们却像进入一团迷雾中,分不清方向。。