形形色色的人们——一名高中生、一位中年商人、黑帮头目等——都收到了三个月前在海难中逝去的亲人发来的神秘讯息。他们被指示当晚前往濑户内海的一座小岛。午夜钟声敲响时,那艘失踪的船只从海中浮现,逝者与生者得以短暂重逢,互诉最后的话语。而后亡者必须再度登船,随沉船永葬海底。。金波(杰弗里·埃文·托马斯 Jeffrey Evan Thomas 配音)是一个拥有神奇能力的少年,年岁渐长的他始终相信,他并不是独自一人,在这个世界上一定存在着许多和他相同的人,他想将这些人聚集在一起,将他们的能力用在对社会有益的方面。没过多久,5个和金波一样的神奇少年浮出了水面,在感到高兴之余,金波也发现,这些少年多多少少都曾因为他们的特异功能而受到排挤和欺辱。 不久,悲剧发生了,某个暴力团伙袭击了这些少年,愤怒和恐惧打碎了少年们的理智,他们决定用他们的能力向带给他们伤害的这个世界进行报复。摆在金波面前的有两条路,一条是和少年们一起进行报复行动,另一条是站在少年们的对立面,保护世界的和平。面对这艰难的选择,金波动摇了。。《黑客帝国动画版》由9段以《黑客帝国》系列电影世界观为基础生发出的短片组成,各篇的角度与风格各异,制作班底汇聚了日本、美国、韩国三地的动画精英。《机器复兴》讲述了MATRIX的历史。机器人不堪人类恶劣对待,终于反抗并将人类化为能源。《少年故事》讲述一名少年突然收到来自网络的召唤,而大批黑衣人开始对他展开围捕。《虚拟程序》展示了一对男女在虚拟训练程序中的片断。《世界纪录》描写一位短跑运动员在接近突破人类极限时终被系统牢牢控制。《超越极限》叙述因为系统错误,平静的街区中出现了一片超常区域。《侦探故事》描写一位侦探被步步引领着试图摆脱系统的桎梏。《矩阵化》讲述一只机器人被人类捕获并驯化的故事。《终极战役》记录了一艘飞船毁灭的经过。。