影片改编自真实事件,1969年七名民权运动分子因在前一年芝加哥民主党代表大会召开时举行抗议活动而被控阴谋罪,这也成为60年代民权运动重要事件之一。。随着和平的到来而走向近代化的木叶隐村。高楼林立,巨大显示屏中播放出影像,连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村,但一般民众也增多,忍者的生存方式也在逐渐改变着。
动漫主要讲述了《火影忍者》主角漩涡鸣人的儿子,漩涡博人的故事。忍者因为和平时代的到来,不再如往日重要。忍者学校也开始设立普通班。在这样一个和平的时代,博人选择了尾随自己父亲的脚印,成为忍者。
故事以这样的背景展开,但逐渐,一切又不和平了起来。博人能否应对呢?他会成为新时代的英雄吗?。十六世纪末,东场西场在朝廷上争权的斗争日趋白热,组建“大同契”抵御外敌的于历卷入其中,因谋逆罪被处以极刑,大同契一案的幕后主使韩申均有庶子韩坚子(白成铉 饰),韩坚子在韩家毫无地位可言,他一次次用暴力谋求尊严,但终不得志。大同契内部的野心家李梦鹤(车胜元 饰)认为抵御外敌先要荡平腐败的朝廷,成功执掌大同契后,李梦鹤将韩申均满门斩杀复仇,于历生前好友——目盲的高手黄处士(黄政民 饰)出面阻止梦鹤,并将重伤的韩坚子救走。梦鹤率领大同契打出反朝廷大旗,在各地掀起暴力反抗。另一方面,拜黄处士为师的韩坚子苦心修炼,踏上了寻找李梦鹤复仇的旅途。在纷纷乱世中,每个人都将面对自己命运的劫数……。