爷爷年逾古稀,身患重病,他要在自己去世前,为自己抚养了八年又非亲非故的孙子小杉寻找到亲生母亲。依靠仅有的一点线索他们踏上了寻亲之旅,一路上遇到了形形色色的人,经历了很多事。虽然最终寻亲的目的未能达成,却让二人更加认识到彼此在生命中存在的意义。。一直想寻根的超人返回了氪星,希望可以找到其他同伴,但那里的一切早已不复存在。而这一去便是5年。
5年后,超人回到了地球,但是周遭的一切已经改变。他发现地球已经习惯了没有超人的保护,他一直爱慕的路易丝因为撰写了一篇“为什么世界不需要超人”的报道而获得普利策大奖。更令他心碎的是,她已经与主编的侄子订婚,而且是一个5岁孩子的母亲了。
另一边,他的死对头莱克斯利用卑鄙手段骗取了巨额遗产,企图卷土重来。在南极莱克斯找到了超人父亲的线索,以及一块含有超级能量的水晶,妄想借助水晶的力量控制地球。
超人能否战胜心魔,再一次挽救地球于水火?。