在横须贺美国海军基地,有趾高气昂的美国人,也有长吁短叹的小帮会哥们儿。日森一家失去了生计,看中了养猪的买卖。听从夏威夷来的崎山说,可以白拿基地的泔水剩饭,于是他们联合一些人做起养猪的生意来,发了横财。地痞,流氓来敲诈他们,他们内部也发生分化,一个叫春驹的在斗争中被打死。一天,日森一家人听说他们吃的肉正是春驹尸体的猪,都恶心地得跑了出去。家长铁次误以为自己得了癌症,儿子欣太的女友跑到街上成了醉鬼美国兵的玩物。同伙中有两伙人都想趁夜幕把猪运出去卖掉。日森的卡车队在前面跑,军治的卡车在后面追,所有人都被卷入了狂奔的猪的漩涡中去……。正享受短暂假期的公安九课少校草薙素子(坂本真绫 配音)突然接到巴特(松田健一郎 配音)的报告,西之内某处大厦遭受恐怖分子袭击,政府高官和商业巨擎被人杀害。在草薙的指挥下,九课的石川、波玛、帕兹、巴特等人通力合作,将恐怖分子彻底制服,但草薙在行动中意外受到神秘病毒感染。在西之内恐怖袭击的同时,远郊的水坝发生爆炸案。新滨县刑警陀古萨(新垣樽助 配音)传唤水坝管理企业负责人沙特博士,对方是来自饱经战火的卡森共和国的卡尔迪斯人。受警方高层施压,陀古萨没有得到任何有用信息。另一方面,草薙一方得知恐怖分子的真实身份,正是卡尔迪斯的游击队组织。两起案件意外联系在一起,其背后隐藏怎样的真相?
本片根据士郎正宗的原作改编,为攻壳机动队前传“ARISE”的第三部。。